bioRxiv: 新冠病毒新突变与受体结合力显然提高上百倍

020年3年末17日，南方医学院张其威教授，复旦大学张弓教授共同通讯在bioRxiv上网络发表文中“RBD mutations from circulating SARS-CoV-2 strains enhance the structure stability and infectivity of the spike protein”的研究课题论文，研究课题发掘出SARS-CoV-2的RBD变异减弱了刺突蛋白质的内部结构稳定性，其中三种病原变异株与ACE-2细胞因子的相辅相成能力减弱了100倍，预料变异病原株的细菌感染力和传播者力将牵涉到极大的减弱。

研究课题一个团队比对了世界之内的RBD变异，发掘出在传播者过程中处于高正选择负面影响下的10个变异体；武汉，珠海，香港和意大利出现的三个RBD变异体的抵消解离数值（KD）比Wuhan-Hu-1病原低两个千分之，这是因为RBD的β-卷曲支架稳定了；同时指出变异的病原已经进化，并且得到更加明显的细菌感染力。5个意大利除去株和1个香港除去株具有相同的RBD变异，可减弱相辅相成亲和力，指出它们可能会起源地更进一步亚谱系。乌鸦和蜈蚣类SARS的冠状病原RBD的KD值可知这种乌鸦类SARS的冠状病原很难或不可能会细菌感染生物；然而，蜈蚣冠状病原可能会会细菌感染生物。无论如何是在选择负面影响下，对RBD极其重要变异的比对进一步加深了我们对SARS-CoV-2分子内部结构进化的了解。SARS-CoV-2与其宿主细胞因子ACE-2相辅相成亲和力的增加，在持续性的COVID-19大流行在此期间，如果未采取有效的预防措施，将依赖于更高细菌感染几率而且细菌感染也将更为严重。

当然文章为了检验由RBD变异引起的功能变动，对SARS-CoV-2和RBD变异体同步进行了分子内部结构动力学模拟以检验其与人ACE-2的相辅相成能力。与Wuhan-Hu-1病原相比，五分之四的RBD变异体（R408I除外）的相辅相成自由能降低。其中三个（N354D和D364Y，V367F，W436R）变异株与人ACE-2的亲和力显着增加，这三个变异体的DG均为-200 kJ / mol，比WH-1病原低约25%。SARS-CoV-2 RBD的KD = 14.7 nM，这三个变异体的抵消解离数值（KD）对于N354D和D364Y双变异计算为0.12 nM，对于V367F变异为0.11 nM，对于W436R为0.13 nM，比WH-1病原低两个千分之，指出变异病原的细菌感染力显着增加。

目前报导的244个SARS-CoV-2核苷酸中，有10个更进一步变异牵涉到在RBD区域。这些变异来自武汉、珠海、香港、英国和意大利、巴基斯坦。其中9个与最早报导的核苷酸只有一个变异，而来自珠海的Shenzhen-SZTH-004有两个变异。同时，研究课题者发掘出变异体V367F来自意大利（两兄弟）和香港（1人），可能会已经有较广泛的传播者。

以上均是计算机模拟样本，可能会还需要更多的实验样本同步进行承托，海区蛋白质质目前在研发S-RBD变异体，同时也期待更进一步感兴趣的研究课题技术人员共同合作。

原始说是：Junxian Ou, et al. RBD mutations from circulating SARS-CoV-2 strains enhance the structure stability and infectivity of the spike protein. bioRxiv. Posted March 17, 2020.